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02 | URBAN MICROBIOME
目に見えない生命と共生する都市へ
〜都市工学と微生物学の融合による新たな都市計画〜
Towards Cities in Harmony with Invisible Life
— Rethinking Urban Planning through the Integration of Urban Engineering and Microbiology —
Research Vision
都市には、人間や建築物、インフラだけでなく、目に見えない膨大な微生物が存在しています。こうした微生物の分布や多様性は、都市の環境とどのように関係しているのでしょうか。本研究では、都市工学と微生物学を融合し、都市空間と微生物群集の関係を明らかにすることで、都市を新たな視点から捉え直すことを目指しています。
DNA解析によって得られる微生物データと、土地利用、緑地、建築物の配置、人々の活動などの都市空間データを組み合わせ、都市環境が微生物の分布や多様性に与える影響を分析しています。さらに、都市に生息する動物の環境DNA解析や都市間比較へと研究を発展させ、目に見えない生物環境を都市計画の新たな評価軸として位置づけることを目指しています。これにより、人間の健康や生態系にも配慮した、持続可能な都市計画・都市デザインへの貢献を目指します。
Research Fields & Activities

Central Urban Area of Toyohashi City, Japan
豊橋市の市街地を対象に、土地利用や都市環境と微生物群集の関係を分析しています。

Toyohashi Citywide, Japan
豊橋市全域を対象に、土地利用や都市環境と微生物群集の関係を分析しています。
Research Projects
Selected Projects
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2026-2032|DNA都市工学:都市を空間・社会・生物の統合システムとして捉える — JSPS 科研費 挑戦的研究(開拓)
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2023-2026|目に見えない微生物から切り開く都市工学の新視点 — JSPS 科研費 挑戦的研究(萌芽)
Research Outputs
Poster Presentation
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2026|Citywide Assesment of the Association Between Land Use and Microbial Communities in Toyohashi City — Akira Kasae, Chin Khai Meng, Takeru Ochi, Akari Matsuba, Seiya Okubo, Katsuya Mautsubo, Yuu Hirose, Haruka Ono, 日本微生物生態学会 第39回高知大会
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2026|Assessment of the Relationship Between Land Use and Microbial Communities in the Urban Area Around Toyohashi Station — Katsuya Mautsubo, Takeru Ochi, Akari Matsuba, Seiya Okubo, Chin Khai Meng, Akira Kasae, Loo Chuan Shen, Shiho Kamakura, Shigeru Kawai, Haruka Ono, Yuu Hirose, 日本微生物生態学会 第39回高知大会
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2026|Assessment of the Relationship Between Land Use and Microbial Communities Across the Toyohashi City Area — Chin Khai Meng, Takeru Ochi, Akari Matsuba, Seiya Okubo, Akira Kasae, Katsuya Mautsubo, Loo Chuan Shen, Shiho Kamakura, Shigeru Kawai, Haruka Ono, Yuu Hirose, 日本微生物生態学会 第39回高知大会
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2025|豊橋市街地における土地利用と微生物叢との関係性の評価 — 真苧坪克弥, 越智雄大, 松葉明里, 大久保誓也, 横山蒼太, Loo Chuan Shen, 小野悠, 広瀬侑, 日本微生物生態学会 第38回東京大会
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2024|豊橋市街地における土地利用が微生物叢に与える影響の評価 — 真苧坪克弥, 越智雄大, 松葉明里, 大久保誓也, 横山蒼太, Loo Chuan Shen, 小野悠, 広瀬侑, 日本微生物生態学会 第37回広島大会
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